Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3BQ502W6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms