Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX19Q49B96 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX19Q49B96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms