Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BBS9Q3SYG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS9Q3SYG4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms