Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTLL9Q3SXZ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms