Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HFEQ30201 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HFEQ30201 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HFEQ30201 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HFEQ30201 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HFEQ30201 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HFEQ30201 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HFEQ30201 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HFEQ30201 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HFEQ30201 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HFEQ30201 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HFEQ30201 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms