Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM71Q2Q1W2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM71Q2Q1W2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms