Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC27Q2M243 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms