Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC5A12Q1EHB4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC5A12Q1EHB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms