Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC142Q17RM4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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