Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PPP1R3AQ16821 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPP1R3AQ16821 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms