Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK4Q16654 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PDK4Q16654 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PDK4Q16654 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PDK4Q16654 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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