Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRNP35Q16560 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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