Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRY1Q16526 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRY1Q16526 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms