Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC6Q16204 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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