Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SNCBQ16143 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNCBQ16143 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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