Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ETFDHQ16134 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETFDHQ16134 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms