Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC1Q15915 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC1Q15915 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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