Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SF1Q15637 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF1Q15637 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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