Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

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Length 735 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS6KA1Q15418 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS6KA1Q15418 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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