Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDK3Q15120 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDK3Q15120 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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