Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF6Q15052 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF6Q15052 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF6Q15052 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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