Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC3Q14003 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC3Q14003 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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