Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNX2Q13950 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms