Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXE3Q13461 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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