Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMS2P3Q13401 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PMS2P3Q13401 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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