Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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SKP2Q13309 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
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SKP2Q13309 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKP2Q13309 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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