Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLAMF1Q13291 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLAMF1Q13291 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms