Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR5A1Q13285 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR5A1Q13285 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms