Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAF3Q13114 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms