Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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