Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH17Q12864 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH17Q12864 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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