Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA1Q09470 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms