Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 BUD21YOR078W 645 nt3.96□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SNF8YPL002C 702 nt3.96□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SPH1YLR313C 1593 nt3.96□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YPR003CYPR003C 2265 nt3.96□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 STP1YDR463W 1560 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 CRD1YDL142C 852 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YGL152CYGL152C 678 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 UTP11YKL099C 753 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 VIP1YLR410W 3441 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 KIN3YAR018C 1308 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YNL011CYNL011C 1335 nt3.95□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 ATP16YDL004W 483 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 RRP42YDL111C 798 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 snR83snR83 306 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 FRQ1YDR373W 573 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 ECM11YDR446W 909 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 FOL2YGR267C 732 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YJR157WYJR157W 363 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 MBR1YKL093W 1020 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 DLT1YMR126C 1029 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SCD6YPR129W 1050 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 MIG1YGL035C 1515 nt3.94□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 LTV1YKL143W 1392 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 GCD2YGR083C 1956 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SYT1YPR095C 3681 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 ASI1YMR119W 1875 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YDR008CYDR008C 351 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YDR149CYDR149C 708 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YOR364WYOR364W 369 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 snR17asnR17a 333 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 DIM1YPL266W 957 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 MUD1YBR119W 897 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SUC2YIL162W 1599 nt3.93□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 BAR1YIL015W 1764 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 FMP25YLR077W 1752 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 CPA2YJR109C 3357 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 MSW1YDR268W 1140 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SPT2YER161C 1002 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 PRP38YGR075C 729 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YHR097CYHR097C 1101 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 PEX15YOL044W 1152 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SME1YOR159C 285 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 CUP9YPL177C 921 nt3.92□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 RPO21YDL140C 5202 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 ITT1YML068W 1395 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 DAN4YJR151C 3486 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 DPP1YDR284C 870 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 YDR526CYDR526C 471 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 PRP21YJL203W 843 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 COQ9YLR201C 783 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 ABP140YOR239W 1887 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 CHK1YBR274W 1584 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 RRN6YBL014C 2685 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 MSD1YPL104W 1977 nt3.91□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 TOP1YOL006C 2310 nt3.9□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 SNT1YCR033W 3681 nt3.9□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 RPO31YOR116C 4383 nt3.9□□□□□ -1.78
NEW1Q08972 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YCR108CYCR108C 192 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 NSE4YDL105W 1209 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 COG2YGR120C 789 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 PDX1YGR193C 1233 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 GEP4YHR100C 558 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YKL131WYKL131W 522 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YPT7YML001W 627 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 RIM11YMR139W 1113 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 RET3YPL010W 570 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.9□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 MTR4YJL050W 3222 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 PET100YDR079W 336 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 RUB1YDR139C 234 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YGL242CYGL242C 546 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 SCM4YGR049W 564 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 EFG1YGR271C-A 702 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 RGI2YIL057C 495 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 AIM19YIL087C 474 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 TEM1YML064C 738 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YMR087WYMR087W 855 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 ASI2YNL159C 870 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YNR062CYNR062C 984 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 DER1YBR201W 636 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 YBR287WYBR287W 1284 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 SWI1YPL016W 3945 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 HCA4YJL033W 2313 nt3.89□□□□□ -1.79
NEW1Q08972 ERT1YBR239C 1590 nt3.89□□□□□ -1.79
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