Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCL9Q07325 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCL9Q07325 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms