Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms