Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDSPL2Q05D32 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTDSPL2Q05D32 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms