Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNB3Q05901 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms