Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALD1Q05682 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CALD1Q05682 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALD1Q05682 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALD1Q05682 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALD1Q05682 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALD1Q05682 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms