Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCZQ05513 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms