Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GBE1Q04446 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBE1Q04446 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBE1Q04446 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms