Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID5AQ03989 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms