Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
ERCC6Q03468 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms