Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2BQ02880 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TOP2BQ02880 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TOP2BQ02880 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms