Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APBA1Q02410 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APBA1Q02410 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms