Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms