Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUD4Q01804 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUD4Q01804 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms