Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IRF9Q00978 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF9Q00978 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms