Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CLTCQ00610 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLTCQ00610 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms