Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK5Q00535 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms