Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms